Inicialmente, se coloca una sonda fina, generalmente a través de la nariz, hasta el estómago. Esta es la única maniobra que, en algunas personas, puede resultar molesta, por producir estornudos (al pasar la sonda por la nariz) o náuseas (al pasar por la garganta). No es una prueba dolorosa.

En algunos casos en los que la colocación de la sonda sea difícil, puede ser necesario utilizar un control radiológico o ayuda mediante endoscopia.

La sonda se deja colocada en la porción inferior del esófago y se conecta a un registrador portátil, donde queda registrado el pH (el grado de acidez) esofágico durante el tiempo que dura el estudio.

Para conseguir resultados fiables, usted debe seguir algunas indicaciones (como señalar cuándo come, cuándo se tumba, cuándo tiene molestias o cuándo toma medicación etc.). La forma de indicar estos eventos depende del sistema registrador y se le comentará cuando se le coloque la sonda.

En principio, y salvo que se indique lo contrario, es conveniente que realice vida normal durante el tiempo que dura la exploración para poder evaluar con la mayor precisión posible lo que ocurre en su actividad diaria habitual.

Durante la exploración, puede sentir la sensación de un cuerpo extraño en garganta. Estas molestias son leves y disminuyen con el tiempo.